Formation Sélection Génomique

Une session de formation avancée sur la sélection génomique a été co-organisée par les deux projets Investissements d’Avenir BreedWheat et PeaMUST à Dijon du 10 au 12 décembre 2014. Cette formation visait à donner, aux chercheurs et ingénieurs impliqués dans la sélection de plantes, une base solide dans l’utilisation des dernières méthodes des nouvelles technologies de sélection : la sélection génomique.

Cette formation abordait des aspects théoriques et pratiques :

  • Introduction aux méthodes de sélection génomique, comparaison entre pois et blé par Mathieu SIOL (INRA Dijon, Départements Santé des plantes et environnement, et Biologie et Amélioration des Plantes)
  • Méthodes statistiques utilisées pour la sélection génomique par Brigitte MANGIN (INRA Toulouse, Département Mathématiques et informatique appliquées)
  • Travaux pratiques 1 : Outils R pour la sélection génomique par Mathieu SIOL, Van Giang TRAN et Gilles CHARMET (INRA Clermont-Ferrand, Département Biologie et amélioration des plantes)
  • Travaux pratiques 2 : Facteurs influençant la précision des prédictions en sélection génomique par Bruno GOFFINET (INRA Toulouse, Département Génétique animale), Gilles CHARMET, Van Giang Tran and Renaud RINCENT (INRA Clermont-Ferrand, Département Biologie et amélioration des plantes)
  • Application de GnpIS-SG par Delphine STEINBACH (INRA Versailles, Département Biologie et amélioration des plantes)
  • Méthodes de prise en compte des interactions génotypes-environnement en sélection génomique par Gilles CHARMET
  • Optimisation des populations de référence par Renaud RINCENT
  • Temps d’échange sur les conditions pour faciliter et réussir l’utilisation des méthodes de sélection génomique animé par Gilles CHARMET et Mathieu SIOL

Anne-Lise Brochot (chef de projet PeaMUST), Emmanuelle Lagendijk (chef de projet BreedWheat), Annabelle Larmure (responsable de tâche PeaMUST), Mathieu SIOL (impliqué dans le projet PeaMUST) et Gilles Charmet (responsable du WP4 de BreedWheat) ont co-organisé cette formation.
32 personnes ont participé à cette formation: 7 personnes du projet PeaMust, 15 personnes du projet BreedWheat et 10 personnes impliquées dans les deux projets. Les participants venaient de plusieurs milieux professionnels : semencier (Agri-Obtentions, Bayer, Caussade semences, Limagrain Momont, RAGT2n Syngenta, Vilmorin), recherche (INRA), transfert de technologie (Wellience), expérimentation variétale (GEVES) et institut technique (Arvalis).

La formation a été jugée bonne via un formulaire d’évaluation à renseigner en ligne par les participants (15 réponses) pour son contenu scientifique (4/5) et sa qualité d’enseignement (3,6/5). Des améliorations pour des formations similaires futures ont également été suggérées.

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