FAITS MARQUANTS

Quelques dates clés du projet

Le projet BreedWheat est un projet de 9 ans, permettant ainsi d’aller jusqu’à la caractérisation de populations développées dans le projet. Différents évènements, résultats et ressources marquent le déroulement du projet, en voici un aperçu :

Septembre 2011
Le projet BreedWheat est lancé !
Le projet Investissements d’Avenir BreedWheat démarre officiellement les jeudi 29 et vendredi 30 Septembre 2011 à Clermont-Ferrand, en présence des 28 partenaires, des financeurs et de la presse.
Août 2012
Sélection d’un panel de 4 600 blés représentant la diversité mondiale
Cet échantillonnage s’est fait parmi les 11 960 blés tendres originaires de 108 pays et présents dans la collection du Centre de Ressources Biologiques Céréales à paille INRA Auvergne Rhône-Alpes. La liste de ces accessions est disponible sur demande à breedwheat@inra.fr
Février 2013
Conception d’une puce de génotypage contenant plus de 420 000 marqueurs SNP
BreedWheat développe l’une des plus importantes puces de génotypage jamais développée chez le blé grâce à la technologie Axiom de la société Affymetrix. Une partie de cette puce, 280 000 marqueurs SNP, est mise à la disposition de la communauté scientifique internationale.
Août 2014
Développement d’une plateforme pour l’inférence de réseaux de régulation des gènes
La plateforme RulNet permettant l’inférence de réseaux de régulation des gènes (http://rulnet.isima.fr/) est développée (Vincent et al., 2015).
Mai 2013
Un nouveau coordinateur pour le projet
Catherine Feuillet ayant assuré le montage de ce projet et son démarrage part pour de nouveaux horizons. Jacques Le Gouis de l’INRA GDEC lui succède en tant que coordinateur.
Juin 2015
Production des données de génotypage sur plus de 7 000 lignées de blé
La puce de génotypage BreedWheat permet de génotyper plus de 7 000 lignées de blé regroupant aussi bien des variétés élites que des lignées exotiques. Ce génotypage est réalisé sur la plateforme de génotypage à haut débit, Gentyane, du centre INRA Auvergne Rhône-Alpes.
Septembre 2015
Développement d’un outil permettant de réaliser de la sélection génomique
Une chaîne d’analyse, appelée BWGS (BreedWheat Genomic Selection), basée sur des bibliothèques ouvertes de R, est réalisée. Elle permet de tester différentes méthodes pour construire et valider des modèles de sélection génomique.
Novembre 2015
Une conférence internationale réunit les chercheurs de la communauté scientifique blé à Clermont-Ferrand
A l’initiative du projet BreedWheat, une conférence internationale, appelée IWIW (International Wheat Innovation Workshop), est organisée à Clermont-Ferrand les 16 et 17 novembre 2015. Les détails du programme, les photos et présentations sont disponibles sur le site web dédié à cet évènement : https://colloque.inra.fr/iwiw
Novembre 2015
Le projet est évalué à mi-parcours
Les membres du comité scientifique international de BreedWheat évaluent l’avancement du projet lors de sa 4ème réunion annuelle. Ils se déclarent globalement impressionnés par les avancées du projet.
Janvier 2016
Production de la séquence annotée du chromosome 1B
Grâce au partage de la séquence du chromosome 1B avec l’IWGSC (International Wheat Genome Sequencing Consortium), le projet BreedWheat a contribué à la production de la séquence de référence du génome entier du blé tendre.
Août 2016
Construction d’une carte génétique comprenant 307 270 loci
Les données de génotypage ont été utilisées pour construire une carte génétique consensus comprenant 307 270 loci, l’une des cartes génétiques avec la plus haute densité jamais produites chez le blé.
Mai 2016
Collecte et formatage des données de phénotypage d’essais réalisés en 2012, 2013 et 2014
Des essais en champ ont été conduits, entre 2012 et 2014, sur 220 variétés de blé dans 27 expérimentations liées à une carence en azote, la résistance à la sécheresse et aux maladies. Ces données couplées aux données de génotypage permettent de réaliser des analyses d’association (GWAS).
Mai 2016
Développement d’un modèle carbone-azote
Un modèle écophysiologique carbone-azote capable de simuler la période post-floraison du blé est achevé et évalué par rapport à des données expérimentales (Barillot et al., 2016A ; Barillot et al., 2016b). Le logiciel est disponible sur la plateforme SourceS sur demande aux auteurs.
Septembre 2016
Sélection d’un panel de diversité de 450 blés
Un panel de 450 accessions d’hiver est sélectionné parmi les 4 600 lignées représentant la diversité mondiale. La liste de ces accessions est disponible sur demande à breedwheat@inra.fr.